Estonian Air jätab kümme sihtkohta: Stockholm, Kopenhaagen, Amsterdam, Brüssel, Oslo, Moskva, Peterburi, Kiiev, Vilnius ja Trondheim.

-Tallinna-Riia liinil lõpetati lennud 18. septembril 2012.

- Tallinna-Tartu liinil toimub viimane lend 21. detsembril ja Tartu-Tallinna liinil 22. detsembril 2012.

-Tallinna-Riia liinil lõpetati lennud 18. septembril 2012.

- Tallinna-Tartu liinil toimub viimane lend 21. detsembril ja Tartu-Tallinna liinil 22. detsembril 2012.

- Tallinna-Joensuu liinil toimub viimane lend 27. detsembril 2012. 13. novembrist kuni 27. detsembrini lendab lennufirma Joensuu liinil hõredama lennugraafiku alusel.

- Tallinna-Jyvaskylä liinil toimub viimane lend 7. jaanuaril 2013.

- Tallinna-Helsingi liinil toimub viimane lend 27. jaanuaril 2013.

- Ajavahemikus 26.01-12.03.2013 peatab Estonian Air lennud Tallinna ja Pariisi vahel. Eelnevalt vähenevad Tallinna ja Pariisi vahelisel liinil lendude sagedused. Lennud Pariisi taastuvad ajutiselt suurema nõudlusega perioodil, s.o. 13.,15.,16.,18., 20., 22., 23. ja 25. märtsil 2013. Ajavahemikus 6.06.-30.08.2013 teenindab Estonian Air Tallinna-Pariisi liini kahe lennuga nädalas.

- Tallinna-Viini liinil toimub viimane lend 23. märtsil 2013.

Estonian Air on otsustanud oma lennugraafikust välja jätta järgmise aasta kevadeks plaanitud Hannoveri, Göteborgi, London City ja Tbilisi lennuliinid, teatas lennufirma avalike suhete juht.